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Il Laboratorio Top-Secret era un'area segreta del Laboratorio Biospaziale. Situato nei pressi del Ponte Principale e collegato ai settori 1 e 6, questo laboratorio era stato progettato per distaccarsi dalla stazione spaziale in caso di emergenza o di violazione della sicurezza. La Federazione Galattica lo costruì per contenere tutti i Metroid clonati dal DNA del piccolo.
Storia[]
Sconfitto l'Aracnorobot e recuperato il Raggio Onda, Samus riuscì ad accedere al Laboratorio Top-Secret. Dopo aver scoperto i numerosi cloni dell'ultimo Metroid prodotti dalla Federazione Galattica, la cacciatrice fu costretta a fuggire a causa di SA-X, la quale aveva appena fatto irruzione nel laboratorio causando un'enorme esplosione che liberò tutti i Metroid. Non appena Samus si rifugiò nel Settore 1 il Laboratorio Top-Secret si distaccò dalla stazione ed esplose nello spazio.