I Blocchi Missile (
su Zebes; 
nel Laboratorio Biospaziale) sono un tipo di blocchi sensibili unicamente, per ragioni di sicurezza, all'effetto di armi esplosive, come Missili e Super Missili. Parte di essi non possono essere rivelati da un esplosione di Bomba Morfosfera, ma soltanto da una Gigabomba. Un Missile Diffusione può propagarsi all'interno delle pareti e distruggere un Blocco di questi. Come viene suggerito in Metroid Prime, questi blocchi potrebbero esser fatti di Arenite.
Appaiono in Metroid Fusion e in Metroid: Zero Mission.